選擇性剪接是指基因表達過程中，前體mRNA內含子剪接時，選擇不同剪接位點從而生成不同轉錄本的現(xiàn)象，是基因轉錄時加工后處理的一個重要步驟。選擇性剪接能調控基因的表達和增加蛋白質產物的多樣性，對細胞的生長和發(fā)育有著重要的影響。植物中存在大量的內含子選擇性剪接現(xiàn)象，在植物的生長發(fā)育及應對外界脅迫反應中起十分重要的作用，然而其在基因組層面的調控機制并不清楚。

      何光明/鄧興旺課題組利用轉錄組測序的方法，對擬南芥Col-0以及其它四種生態(tài)型內含子選擇性剪接的差異進行了分析。同時以Col-0為母本，配制了其余4種生態(tài)型與Col-0的雜交子一代，利用親本和雜交子一代的轉錄組分析內含子選擇性剪接的順反式調控機制。研究表明，擬南芥中內含子選擇性剪接的變化主要受到順式效應的調控，與剪接位點周圍基因組序列變化有關，且受到寡聚嘧啶序列的影響。基因功能富集分析發(fā)現(xiàn)，生態(tài)型間有選擇性剪接差異的基因富集在脅迫響應相關通路中，而這些基因的表達水平在生態(tài)型間并沒有差異。全基因組關聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，基因組上一些影響剪接位點強度的序列變異同時也與脅迫響應有關。基于以上結果，作者認為植物中內含子選擇性剪接的變化主要受到剪接位點周圍基因組序列變異的順式作用調控，在功能上可能與植物對外界刺激響應相關。