- 簡(jiǎn)介
- 科研領(lǐng)域
- 學(xué)術(shù)發(fā)表
個(gè)人簡(jiǎn)介
2002-2013，北京林業(yè)大學(xué)，生物技術(shù)系學(xué)士，森林培育系博士
2010-2014，美國耶魯大學(xué)，分子和細(xì)胞發(fā)育系，聯(lián)合培養(yǎng)博士，博士后
2014-2016，美國加州大學(xué)戴維斯分校，博士后
2016-2022，南方科技大學(xué)，生物系，研究副教授
2021-至今，北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院，研究員
教育經(jīng)歷
2002-2013，北京林業(yè)大學(xué)，生物技術(shù)系學(xué)士，森林培育系博士
2010-2014，美國耶魯大學(xué)，分子和細(xì)胞發(fā)育系，聯(lián)合培養(yǎng)博士，博士后
2014-2016，美國加州大學(xué)戴維斯分校，博士后
工作經(jīng)歷
2016-2022，南方科技大學(xué)，生物系，研究副教授
2021-至今，北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院，研究員
科研領(lǐng)域
一、作物再生過程中細(xì)胞全能性的獲得和再生細(xì)胞分化發(fā)育的命運(yùn)決定機(jī)制
植物的細(xì)胞全能性獲得和再次分化是細(xì)胞生物學(xué)最有價(jià)值的科學(xué)問題之一，也是大多數(shù)作物轉(zhuǎn)基因技術(shù)實(shí)施的基礎(chǔ)發(fā)育過程。對(duì)作物愈傷組織發(fā)育的研究往往受限于傳統(tǒng)研究手段，特別是對(duì)細(xì)胞異質(zhì)性的研究缺乏理想的研究技術(shù)。本課題組利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組等技術(shù)，檢測(cè)作物再生過程中各類型細(xì)胞的基因表達(dá)、染色體開放區(qū)域，鑒定新的細(xì)胞類型特征基因，對(duì)細(xì)胞發(fā)育進(jìn)行擬時(shí)序分析，建立基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行驗(yàn)證，為現(xiàn)在農(nóng)業(yè)分子育種和深度發(fā)掘重要農(nóng)藝性狀的調(diào)控機(jī)制提供了前所未有的契機(jī)。
二、作物轉(zhuǎn)基因引起的小RNA干擾和基因沉默機(jī)制
植物基因編碼區(qū)產(chǎn)生的小干擾RNA（small interfering RNA，siRNA）能夠誘導(dǎo)基因沉默，具有重要的植物發(fā)育調(diào)節(jié)和脅迫響應(yīng)功能。siRNA是小RNA干擾技術(shù)的主效因子，其也會(huì)造成轉(zhuǎn)基因應(yīng)用中不可控的基因沉默，嚴(yán)重影響了現(xiàn)代作物分子育種的生產(chǎn)應(yīng)用。然而，科學(xué)界對(duì)植物基因編碼區(qū)siRNA產(chǎn)生機(jī)制的研究非常有限，主要的原因是植物基因編碼區(qū)產(chǎn)生的siRNA較少，難以發(fā)現(xiàn)誘導(dǎo)多個(gè)植物基因產(chǎn)生siRNA的條件或遺傳材料。因此，該領(lǐng)域的科學(xué)研究空白亟待探索。本課題組的研究旨在解決農(nóng)作物轉(zhuǎn)基因技術(shù)容易出現(xiàn)基因沉默，導(dǎo)致大量目標(biāo)基因降解無法實(shí)現(xiàn)分子育種應(yīng)用的突出問題。研究植物基因編碼區(qū)siRNA產(chǎn)生機(jī)制，拓展對(duì)小干擾RNA的認(rèn)知，加強(qiáng)對(duì)基因沉默發(fā)生機(jī)制的理解，為開發(fā)高效的RNA干擾技術(shù)和調(diào)控轉(zhuǎn)基因中的基因沉默提供新的原理和方法。
三、作物中單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組以及三代單分子測(cè)序技術(shù)的開發(fā)優(yōu)化和應(yīng)用
近年來，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及三代測(cè)序技術(shù)等逐漸興起，但由于成本高、操作難度大以及作物本身的復(fù)雜性等缺點(diǎn)仍需完善。本課題組在公共技術(shù)平臺(tái)建設(shè)的基礎(chǔ)上，對(duì)作物的單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)進(jìn)行開發(fā)和優(yōu)化，同時(shí)和多個(gè)國際領(lǐng)先的生物技術(shù)公司以及多個(gè)課題組展開交流合作，并在作物轉(zhuǎn)錄后基因沉默機(jī)制的細(xì)胞特異性表達(dá)和功能上取得了顯著的前期實(shí)驗(yàn)成果。本課題組也在基于作物的ONT三代單分子超長DNA片段測(cè)序的方法進(jìn)行改良和優(yōu)化，為作物基因組復(fù)雜重復(fù)區(qū)域的解析與高質(zhì)量基因組組裝提供了解決方案，推進(jìn)了作物現(xiàn)代分子育種和優(yōu)良性狀改良的進(jìn)程。
學(xué)術(shù)發(fā)表
1. Song X, Guo P, Wang M, Chen L, Zhang J, Xu M, Liu N, Liu M, Fang L, Xu X, Gu Y, Xia K and Li B. 2023. Spatial transcriptomic atlas of shoot organogenesis in tomato callus. bioRxiv, pp.2023-02.
2. Wu H *, Li Bosheng *, Iwakawa HO, Pan Y, Tang X, Ling-hu Q, Liu Y, Sheng S, Feng L, Zhang H, Zhang X. Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation. Nature. 2020 581(7806):89-93. (一區(qū)，影響因子50，引用42)
3. Li Bosheng*, Wu H*, Guo H. Plant mRNA decay: extended roles and potential determinants. Current opinion in plant biology. 2018 45:178-84. （一區(qū)，影響因子8）
4. Li Yang *, Bosheng Li *, X. Z , J. L, G. H, X. D, C. A and Deng XW. Salicylic acid biosynthesis is enhanced and contributes to increased biotrophic pathogen resistance in Arabidopsis hybrids. Nature Communications, 2015 6:7309, *equal contributions （一區(qū)，影響因子11.47 引用次數(shù) 81）
5. Chen F*, Li Bosheng*, D. C. JB, Shi X, Deng XW. Photoreceptor partner FHY1 has an independent role in gene modulation and plant development under far-red light. PNAS. 2014 111(32):11888-93.35 (* equal contribution).（一區(qū) 影響因子11）
6. Chen F*, Li Bosheng*, D. C. JB, Shi X, Deng XW. Arabidopsis Phytochrome A Directly Targets Numerous Promoters for Individualized Modulation of Genes in a Wide Range of Pathways. The Plant Cell. 2014 16;26(5):1981-1991. 35 (* equal contribution). （一區(qū)，影響因子9.34 引用次數(shù) 47）
7. Jin D*, Li Bosheng*, Deng XW, Wei N. Plant COP9 Signalosome subunit 5, CSN5. Plant Sci. 2014 : 224:54-61. 35 (* equal contribution). (二區(qū)，影響因子3.9 引用次數(shù)11)
8. Li Bosheng, D. H, Li J, Deng XW, Yin Weilun, Xia Xinli . Global identification of miRNAs and targets in P. euphratica under salt stress. Plant Molecular Biology 2013 81: 525-539. （二區(qū) 影響因子4.25 引用次數(shù) 98）
9. O. X*,J.L*, G. L*, Li Bosheng*, Chen B, Shen H, Huang X, Mo X, Wan X, Lin R, Li S, Wang H and Deng XW. Genome-Wide Binding Site Analysis of FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL3 Reveals Its Novel Function in Arabidopsis Development. The Plant Cell. 2011 Jul;23(7):2514-35 (* equal contribution). （一區(qū) 影響因子9.34 引用次數(shù) 98）
10. Li Bosheng, Q. Y, D. H, Yin Weilun, Xia Xinli Genome-wide characterization of new and drought stress responsive microRNAs in Populus euphratica. Journal of Experimental Botany 2011 Jul;62(11):3765-79. （一區(qū)，影響因子7 引用次數(shù) 270）
11. Li Bosheng, W. Yin, and X. Xia, Identification of microRNAs and their targets from Populus euphratica. BBRC 2009, 388272-7. （三區(qū) 影響因子2.3 引用次數(shù) 49）